臭氧在短时间内即可分解，形成氧气，所以不会污染环境，在水中具有更强的杀菌能力，可以迅速将细菌和病毒杀灭，当达到—定浓度后，可在数秒至数分钟之间杀灭病原微生物（对大肠杆菌20秒钟杀灭率98%；对艾滋病毒3分钟杀灭率100%；对甲型流感病毒5分钟杀灭99%；对支原体、衣原体等10分钟杀灭率99.85%；对乙型肝炎表面抗原20分钟杀灭率99.99%)，是已知消毒剂中速度非常快的一种。

臭氧在治疗感染性疾病，皮肤病方面有显著的作用，原理如下：
1.病毒感染细胞的途径是通过脂质外壳上的受体和机体细胞结合，臭氧可以使病毒脂质外壳上的受体结构改变，从而使病毒失去活性。
2.臭氧可以使病毒的脂质外壳受到破坏，从而直接杀死病毒。
3.病毒侵犯正常的机体细胞后，正常的机体免疫细胞会产生过氧化氢来杀灭病毒，臭氧可以加强这个效应。
4.臭氧可以增加白细胞数目，提高粒细胞的吞噬功能和数量，刺激单核细胞的形成．激活T细胞，促进干扰素、白介素等细胞因子的释放．启动抗体依赖细胞介导的细胞毒作用（ADCC），显著增强机体抗病毒的能力。臭氧在人体血液中可以导致细胞因子的生理性释放。
5.臭氧在体内可以和体液反应生成过氧化氮，过氧化氢可穿透细菌和病毒的蛋白质膜，破坏膜保护，使细菌和病毒的脂质膜和蛋白质膜融合，导致细胞膜变硬易碎，还可通过它的强氧化作用断裂细菌及病毒的细胞壁来杀死细菌及病毒。
6.臭氧可以直接破坏病毒核糖核酸（RNA）或脱氧核糖核酸（DNA）物质。
7.病毒为厌氧徽生物，臭氧可以提供足够的活性氧，从而使病毒失去生存的环境。

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