医用臭氧治疗仪起到提高机体免疫功能，促进血液循环，新陈代谢的作用，通过臭氧在病患处直接注射或者与血液混合等方式治疗疾病，医用臭氧治疗仪的作用与功效可达全身，对人体血液、代谢、心脏、循环系统等具有一定的改善作用。

人的机体是一个循环运作的整体，如果其中一个脏器功能失常或者血液不畅，代谢异常都会影响到其他的器官，使整体失去平衡，身体抵抗力下降，如果没有及时的修复容易引发各种病变。

当进行臭氧治疗仪大自血治疗时，臭氧氧化处理的血液作用于全身，臭氧能直接激活内脏的细胞，调节患病器官的机能，从而使机体恢复平衡。 自体血回输治疗中，臭氧激活免疫活性细胞的第一步很可能与红细胞通过细胞膜组成成分的不饱和脂肪酸分解有关。短链的氢过氧化物进入细胞间隙，并激活核因子NFKB，通过激活细胞核mRNA，翻译和相应的蛋白质合成，最后释放出特异性的细胞因子，这些发生在体外；再输入红细胞和免疫活性细胞激活的患者的自身血液；随之是单核细胞转移过程，它们移进各种淋巴器官，从而传递信息并激活其他免疫活性细胞。

 臭氧能扩张心脏、手足以及肺部的血管，使心率加快，增加心排出量，降低血管阻力。臭氧能调节激素的代谢，包括黄体酮、甲状腺素、多巴胺、去甲肾上腺素等。臭氧还能激活(直接或间接)氧化酶系统，促进机体清除过多的自由基。